Üniversite eğitimine devam etmek için Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi'ne kaydoldu ve 1989 yılında bu fakülteden mezun oldu. Musa Işın, daha sonra 1990 yılında Erzurum Kaymakam Adaylığı sınavını kazandı.
Kariyerine 1991 yılında Erzurum-Aşkale Kaymakam Vekilliği ile başlayan Musa Işın, 1992-1993 yıllarında İngiltere'de yabancı dil ve mesleki eğitim aldı. Dönüşünde, 1994-1995 yıllarında Denizli-Baklan Kaymakamlığı, 1995-1997 yıllarında Şırnak-Beytüşşebap Kaymakamlığı, 1997-2001 yıllarında Sivas-Gürün Kaymakamlığı, 2001-2006 yıllarında Zonguldak-Çaycuma Kaymakamlığı görevlerini üstlendi.
Türk İdareciler Derneği tarafından Zonguldak Çaycuma İlçesinde yaptığı başarılı çalışmalar nedeniyle 2003 yılında Yılın Başarılı Mülki İdare Amiri seçilen Musa Işın, bu başarısını 2005 yılında Sosyal Hizmetler ve Çocuk Esirgeme Kurumu Genel Müdürlüğü tarafından Altın Madalya Beratı ile taçlandırıldı.
Kariyerindeki bir diğer önemli dönem, 2006-2007 yıllarında Konya-Kulu Kaymakamlığı, 2007-2008 yıllarında Mülkiye Müfettişliği, ve 2008-2013 yıllarında Mülkiye Başmüfettişliği görevlerini üstlendi. Bu süreçte, İçişleri Bakanlığı tarafından yürütülen Avrupa Birliği Siyasi Kriterleri geliştirme projesinde çalıştı. Ayrıca, 2011 yılında ABD'de Northern İllinois Üniversitesi'nde Kamu Yönetimi üzerine eğitim ve araştırmalara katıldı, 2012 yılında Hollanda Dışişleri Bakanlığı'nın Avrupa Birliğine Aday Ülkelere yönelik programlarından birine katılarak "Adalete Erişim" konulu çalışmalara katkı sağladı.
2014 yılında, İçişleri Bakanlığı Genel Sekreteri olarak atanarak büyük bir sorumluluk üstlendi. Bu dönemdeki başarılı çalışmalarıyla 2015 yılında Türkiye Avrasya Araştırmalar Merkezi (TASAM) tarafından Vizyoner Bürokrat Ödülü'ne layık görüldü. Ardından, 2015-2017 yılları arasında Ağrı Valiliği görevini başarıyla yürüttü.
Son olarak, 10 Ağustos 2023 tarihinde 2023/376 sayılı Cumhurbaşkanlığı Kararı ile Kütahya Valiliği'ne atanarak kariyerine yeni bir ivme kazandırdı. Evli olan Musa Işın'ın 2 çocuğu bulunmakta ve İngilizce dilini de başarıyla kullanabilmektedir.